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所有能被微生物利用并構成細胞代謝產物碳源的物質，統稱為碳源物質。碳源物質通過細胞中的一系列化學變化被微生物用來合成各種代謝產物。微生物對碳化合物的需求非常廣泛。根據碳源的不同，碳源物質可分為無機碳源物質和有機碳源物質。糖是一種更好的碳源，特別是單糖（葡萄糖、果糖）、雙糖（蔗糖、麥芽糖、乳糖），絕大多數微生物都可以使用。此外，許多微生物還可以使用簡單的有機酸、氨基酸、醇、醛、酚等含碳化合物。因此，我們經常在生產培養基時添加葡萄糖，蔗糖作為碳源。淀粉、果膠、纖維素等，這些有機物質在細胞內分解代謝提供小分子碳框架外，產生合成代謝所需的能量，因此一些碳源物質既是碳源物質，也是能量。

在微生物發酵行業，玉米粉、米糠、麥麩、土豆、甘薯、各種野生植物淀粉等各種農副產品經常被用作微生物生產廉價的碳源。這種碳源通常包含幾種營養元素